170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4677 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 210 aa  430  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  42.19 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  40.85 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  38.65 
 
 		 214 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  37.19 
 
 		 216 aa  124  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  37.63 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  34.74 
 
 		 208 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  36.22 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  36.22 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  36.22 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  37.7 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  37.02 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  34.74 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  34.74 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  36.21 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  35.96 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  34.74 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  32.51 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 		 208 aa  104  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  32.68 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  37.63 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  34.81 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  37.17 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  30.1 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  33.85 
 
 		 242 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  28.96 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  31.9 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  24.75 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2624  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.722886  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  24.87 
 
 		 180 aa  62  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  28.34 
 
 		 197 aa  62  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  27.23 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  26.83 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  34.07 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  23.28 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  23.28 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  23.71 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  34.15 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  34.15 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  34.15 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  24.55 
 
 		 189 aa  52.4  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  24.28 
 
 		 174 aa  52.4  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  22.7 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  23.66 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  26.74 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  22.42 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1614  isochorismatase hydrolase  28.78 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  26 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  24.57 
 
 		 172 aa  49.7  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  26.23 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  26.23 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  26.23 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  23.47 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  27.67 
 
 		 289 aa  49.3  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  25.95 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  24.18 
 
 		 181 aa  48.9  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  26.17 
 
 		 264 aa  48.9  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  24.46 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  23.16 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  31.13 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  22.04 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  24.48 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  24.12 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  22.04 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  26.53 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  25.99 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  22.04 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  22.04 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  22.04 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  24.46 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  22.82 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  25.68 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  29.84 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19830  nicotinamidase-like amidase  26.42 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  30.1 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  30.1 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  24.47 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  22.4 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>