More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2308 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  100 
 
 		 211 aa  434  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  76.78 
 
 		 213 aa  336  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  75.83 
 
 		 213 aa  332  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  75.83 
 
 		 213 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  75.83 
 
 		 213 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  72.46 
 
 		 213 aa  310  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  56.6 
 
 		 227 aa  234  8e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  54.46 
 
 		 214 aa  226  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  56.99 
 
 		 210 aa  223  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  50.72 
 
 		 209 aa  215  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  51.47 
 
 		 242 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  51.56 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  48.45 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  43.54 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  48.21 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  44.92 
 
 		 209 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  39.71 
 
 		 208 aa  158  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  48.62 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  45.77 
 
 		 216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  46.63 
 
 		 208 aa  151  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  46.96 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  44.28 
 
 		 213 aa  148  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  39.71 
 
 		 247 aa  144  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  43.96 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  43.96 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  43.96 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  45.4 
 
 		 223 aa  141  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  47.03 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  42.72 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  37.7 
 
 		 210 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  36.62 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  37.62 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  35.32 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  35.24 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  32.68 
 
 		 221 aa  99  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  36.07 
 
 		 187 aa  94  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  34.86 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  38.99 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  32.57 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  35.09 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.09 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  24.48 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  29.8 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  36.2 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  36.2 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  37.76 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  26.7 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  26.16 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  32.72 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  31.14 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  30.57 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  31.14 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  31.14 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  27.04 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  31.45 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  28.85 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  30.13 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  27.88 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  29.8 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  26.02 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  30.65 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  29.11 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  27.47 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  26.16 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  31.94 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2624  isochorismatase hydrolase  31.93 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.722886  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  25.41 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  25.27 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  24.86 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  26.74 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  26.97 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2915  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  27.93 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>