More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5651 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  455  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  76.47 
 
 		 222 aa  351  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  75.57 
 
 		 222 aa  350  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  68.66 
 
 		 231 aa  300  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  71.5 
 
 		 231 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  66.82 
 
 		 223 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  65.3 
 
 		 236 aa  284  9e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  64.38 
 
 		 225 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  62.27 
 
 		 230 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  60.63 
 
 		 240 aa  271  6e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  62.1 
 
 		 225 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  60.55 
 
 		 236 aa  265  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  60.56 
 
 		 228 aa  263  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  61.29 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  63.3 
 
 		 226 aa  259  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  62.84 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  63.55 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  60.28 
 
 		 223 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  62.04 
 
 		 226 aa  251  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  56.02 
 
 		 232 aa  246  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  61.47 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  61.47 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  59.91 
 
 		 233 aa  241  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 281 aa  241  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  59.71 
 
 		 222 aa  221  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  59.71 
 
 		 222 aa  221  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  59.71 
 
 		 222 aa  221  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  53.55 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  51.56 
 
 		 232 aa  211  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  50.22 
 
 		 231 aa  209  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  50.89 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  48.87 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  48.2 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  47.51 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  47.75 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  47.96 
 
 		 239 aa  201  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  47.51 
 
 		 234 aa  201  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  47.96 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  48.83 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  49.11 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  46.67 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  48.83 
 
 		 228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  47.06 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  44.14 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  46.64 
 
 		 389 aa  194  9e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  48.11 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  48.66 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  46.89 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  42.53 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  40.62 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  30.84 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  30.84 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  30.84 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  30.84 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  30.84 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  34.74 
 
 		 274 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  30.53 
 
 		 230 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  30.53 
 
 		 230 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  28.51 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  30.4 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  33.83 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  30.14 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  30.09 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  29.6 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  27.48 
 
 		 244 aa  93.6  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 245 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  27.35 
 
 		 252 aa  89  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 243 aa  86.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  28.85 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  34.59 
 
 		 196 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 258 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  34.05 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  29.46 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  28.9 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  37.58 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  29.46 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  29.56 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  36.09 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 		 190 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  29.72 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  33.67 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  31.35 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>