More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0124 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
180 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  43.68 
 
 
172 aa  148  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  42.29 
 
 
188 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  38.2 
 
 
193 aa  137  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  40.24 
 
 
203 aa  133  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  37.21 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  35.5 
 
 
196 aa  122  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  38.01 
 
 
201 aa  120  7e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  38.1 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  40.35 
 
 
174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  34.91 
 
 
214 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 
201 aa  116  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 
200 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  34.3 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  35.96 
 
 
193 aa  104  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  35.96 
 
 
193 aa  104  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  37.28 
 
 
176 aa  104  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  35.96 
 
 
193 aa  104  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  39.71 
 
 
201 aa  102  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  35.67 
 
 
201 aa  102  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 
190 aa  97.8  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 
193 aa  97.1  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  32.94 
 
 
174 aa  95.5  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  36.07 
 
 
189 aa  94.7  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  32.3 
 
 
213 aa  94.7  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  35.63 
 
 
205 aa  94.4  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  32.74 
 
 
195 aa  92.8  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 
192 aa  93.2  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  29.09 
 
 
190 aa  90.1  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  32.47 
 
 
216 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  32.47 
 
 
216 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1827  isochorismatase hydrolase  32.47 
 
 
216 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  30.73 
 
 
285 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  30.73 
 
 
285 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  30.73 
 
 
285 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  34.15 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  30.73 
 
 
285 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  30.73 
 
 
285 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  32.62 
 
 
210 aa  89.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  36.26 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  30.73 
 
 
285 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  30.73 
 
 
285 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  30.73 
 
 
285 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  30.17 
 
 
285 aa  89.4  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  32.07 
 
 
221 aa  89.4  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  28.92 
 
 
192 aa  89  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  28.89 
 
 
291 aa  89  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  30 
 
 
284 aa  88.6  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  33.7 
 
 
285 aa  88.2  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  36.26 
 
 
182 aa  88.2  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  36.26 
 
 
182 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  29.05 
 
 
291 aa  87.8  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 
182 aa  87.8  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  35.16 
 
 
182 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  35.1 
 
 
221 aa  87.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  35.14 
 
 
182 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  36.81 
 
 
183 aa  87  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  36.26 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 
212 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 
222 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  28.8 
 
 
182 aa  85.5  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  36.22 
 
 
192 aa  85.5  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  31.28 
 
 
284 aa  85.5  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0639  Isochorismatase  32.4 
 
 
216 aa  85.1  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316933  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 
209 aa  84.7  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 
227 aa  84.7  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 
176 aa  84.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  30.17 
 
 
285 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  30.17 
 
 
285 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  30.17 
 
 
285 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  30.17 
 
 
285 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  30.17 
 
 
285 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  33.91 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  34.59 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  29.1 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  34.07 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  30.72 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  29.12 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 
226 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3544  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  32.22 
 
 
297 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3617  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3549  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  32.22 
 
 
297 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  30.06 
 
 
283 aa  81.6  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  30.98 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  31.36 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 
239 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  34.59 
 
 
183 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  31.67 
 
 
297 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  31.25 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  32.22 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>