250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3075 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  100 
 
 		 283 aa  591  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  62.9 
 
 		 285 aa  384  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  62.9 
 
 		 285 aa  384  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  62.9 
 
 		 285 aa  384  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  62.77 
 
 		 285 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  62.77 
 
 		 285 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  62.77 
 
 		 285 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  62.77 
 
 		 285 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  63.12 
 
 		 284 aa  385  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  65 
 
 		 284 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  62.9 
 
 		 285 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  62.9 
 
 		 285 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  62.9 
 
 		 285 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  62.77 
 
 		 285 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  62.9 
 
 		 285 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  62.9 
 
 		 285 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  61.84 
 
 		 285 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  59.15 
 
 		 287 aa  343  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  60.49 
 
 		 291 aa  332  5e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  54.55 
 
 		 291 aa  326  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  58.8 
 
 		 291 aa  317  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  46.85 
 
 		 294 aa  278  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  47.65 
 
 		 296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  47.65 
 
 		 285 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0011  isochorismatase  46.81 
 
 		 290 aa  259  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  47.93 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0014  isochorismatase  46.45 
 
 		 290 aa  255  6e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  45.79 
 
 		 297 aa  254  9e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  43.49 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1633  isochorismatase  44.68 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.741759  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  43.49 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  43.49 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  45.08 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  47.12 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  43.4 
 
 		 295 aa  242  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  43.4 
 
 		 295 aa  242  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  43.4 
 
 		 295 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  43.4 
 
 		 295 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  43.4 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  43.85 
 
 		 327 aa  239  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  43.4 
 
 		 295 aa  238  8e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  42.45 
 
 		 278 aa  237  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.26 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  42.71 
 
 		 293 aa  222  7e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1027  Isochorismatase  50.75 
 
 		 212 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  decreased coverage  0.000215707 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3619  isochorismatase  50.24 
 
 		 251 aa  208  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  44.88 
 
 		 207 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  46.15 
 
 		 211 aa  192  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  44.39 
 
 		 207 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  46.48 
 
 		 221 aa  192  8e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  44.39 
 
 		 207 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  44.39 
 
 		 207 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  44.93 
 
 		 221 aa  189  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5030  Isochorismatase  44.39 
 
 		 207 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  44.5 
 
 		 207 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  46.46 
 
 		 218 aa  185  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  41.34 
 
 		 264 aa  185  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  45.83 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  47 
 
 		 207 aa  178  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  44.85 
 
 		 201 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0639  Isochorismatase  42.51 
 
 		 216 aa  172  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316933  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  33.98 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 180 aa  81.6  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  30.27 
 
 		 192 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 		 190 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  30.12 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 193 aa  72  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  31.95 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  29.02 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  26.2 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  27.38 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  27.98 
 
 		 179 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  27.32 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  28.11 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  26.7 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  30.12 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  27.38 
 
 		 179 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  27.88 
 
 		 179 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  27.98 
 
 		 179 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  27.38 
 
 		 179 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  27.88 
 
 		 179 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  27.98 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  26.49 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  26.79 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  25.93 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  26.22 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  26.79 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  26.01 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  25.43 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  25.61 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  29.11 
 
 		 200 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>