More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0263 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 189 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  52.72 
 
 		 190 aa  198  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  50.27 
 
 		 195 aa  188  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  51.09 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  48.39 
 
 		 188 aa  178  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  46.11 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  49.71 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  39.04 
 
 		 235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  40.86 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2022  isochorismatase hydrolase  35.84 
 
 		 221 aa  91.7  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85317  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  31.93 
 
 		 176 aa  90.9  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  38.31 
 
 		 214 aa  90.5  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  38.22 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 189 aa  88.6  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  32.91 
 
 		 203 aa  88.6  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  31.82 
 
 		 389 aa  87.8  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 172 aa  84.7  8e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  34.24 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  29.87 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  28.4 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  32.74 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  27.27 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  25.79 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  36.23 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  36.23 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  32.87 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  28.76 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  31.4 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  31.06 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  31.14 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  36.18 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  30.39 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  26.13 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  32.56 
 
 		 231 aa  72  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  28.24 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  31.18 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  28.67 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  26.84 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 239 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  30.57 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  29.53 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  33.92 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  28.98 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  27.06 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1827  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  26.34 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  28.03 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  26.77 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  26.47 
 
 		 230 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 		 266 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  26.47 
 
 		 230 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  29.89 
 
 		 227 aa  67  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  26.47 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  31.71 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  30.39 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  26.47 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 		 215 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  29.53 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  26.47 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  26.09 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  31.93 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  32.89 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  31.93 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  28.89 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  25.81 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  29.34 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  31.93 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>