More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2022 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2022  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 221 aa  437  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85317  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  39.27 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  35.08 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  36.42 
 
 		 193 aa  101  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  35.84 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  36.04 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  34.52 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  29.81 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  27.65 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  28.25 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  32.75 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  38.6 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  32.16 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  34.95 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  29.57 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  39.09 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  39.18 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  33.01 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  39.09 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  30.84 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  31.15 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  36.02 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  30.41 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  33.85 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  30.89 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  33.85 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  28.8 
 
 		 389 aa  62.4  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  31.49 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  30.68 
 
 		 231 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  34.68 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  28.41 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  30.87 
 
 		 233 aa  62  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  28.41 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  25 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  27.1 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  27.94 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  32.97 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  28.5 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  24.19 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  32.64 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  27.75 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  29.23 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  28.8 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  26.29 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  29.29 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  27.36 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  23.95 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  31.33 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  30.11 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  29.29 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  29.29 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  29.29 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  28.82 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  31.12 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  29.1 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  28.5 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  27.37 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  29.29 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  30.56 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  29.29 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  29.1 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  24.12 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  27.51 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  37.78 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  28.07 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  26.34 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  27.32 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  27.42 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  27.12 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  41.77 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  28.79 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  41.77 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>