More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02070 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  100 
 
 		 258 aa  494  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3109  isochorismatase hydrolase  53.06 
 
 		 207 aa  155  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456789  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2624  isochorismatase hydrolase  48.8 
 
 		 226 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.722886  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  36.41 
 
 		 224 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 215 aa  118  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 223 aa  85.9  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  27.04 
 
 		 189 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  31.88 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  31.56 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  32.29 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  32.27 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  33.04 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 199 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.74 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  31.82 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  25.98 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  27.88 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  31.42 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  31.11 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  29.28 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  31.48 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  28 
 
 		 185 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  27.18 
 
 		 184 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  32.27 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  28 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  31.63 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  33.17 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  28 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  28 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  34.55 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  47.76 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  32 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  28.44 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  32 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  32 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  32 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  30.54 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  48.72 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  29.9 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  31.35 
 
 		 187 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  30.38 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  34.68 
 
 		 186 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  30 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  27.55 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  31.35 
 
 		 187 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 212 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  33.8 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  28 
 
 		 184 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  31.35 
 
 		 187 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  25.96 
 
 		 184 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  27.5 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  40.82 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  34.52 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  30.1 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  30.1 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  30.1 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  31.5 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  25.67 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  31.97 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  25.59 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  31.84 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  30.1 
 
 		 195 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  27.75 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  25.38 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  29.74 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  31.49 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  27.94 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  28.99 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  28.99 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  27.04 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  28.99 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  31.28 
 
 		 211 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  29.23 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  33.96 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>