More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3534 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 204 aa  418  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  71.43 
 
 		 205 aa  303  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  67.65 
 
 		 217 aa  301  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  70.1 
 
 		 201 aa  298  5e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  69.74 
 
 		 213 aa  294  5e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  66.32 
 
 		 213 aa  273  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  60.61 
 
 		 213 aa  247  8e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  53 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0874  isochorismatase hydrolase  34.5 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  35.88 
 
 		 209 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11593  hypothetical protein  33.51 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.277049  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  36.31 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  34.43 
 
 		 533 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5191  isochorismatase hydrolase  32.65 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  35.36 
 
 		 231 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  34.05 
 
 		 230 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 		 231 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  34.05 
 
 		 230 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  35.79 
 
 		 241 aa  95.5  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  34.05 
 
 		 231 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  34.05 
 
 		 231 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 		 231 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2596  hypothetical protein  29.08 
 
 		 196 aa  95.1  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  32.45 
 
 		 228 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  32.81 
 
 		 230 aa  94.7  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1030  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  33.51 
 
 		 231 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  32.04 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  32.28 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  31.91 
 
 		 230 aa  92.8  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  30.19 
 
 		 232 aa  92.4  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  34.68 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  34.25 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  31.75 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  31.22 
 
 		 389 aa  89.7  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  31.44 
 
 		 234 aa  89  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  35.36 
 
 		 258 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  31 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  31 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  31 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  31 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  31 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  31 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  30.33 
 
 		 227 aa  88.2  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 199 aa  87.8  9e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  30.48 
 
 		 233 aa  87.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  27.01 
 
 		 377 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  30.5 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  29.32 
 
 		 231 aa  85.5  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 214 aa  85.1  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 248 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 207 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  33.15 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  34.59 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  29.79 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  29.1 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  31.75 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  31.75 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  31.75 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  31.75 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  31.75 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  29.5 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  29.26 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  31.01 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  31.12 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  29 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  32.68 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  24.21 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  25.24 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0690  isochorismatase  31.35 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0385693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  34.88 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  34.88 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  29.59 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  30.1 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  28.41 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>