More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1936 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 207 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5987  putative isochorismatase family protein  74.02 
 
 		 204 aa  323  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104192 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3766  isochorismatase hydrolase  65.98 
 
 		 201 aa  260  8.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0690  isochorismatase  62.18 
 
 		 200 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0385693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0804  isochorismatase hydrolase  55.67 
 
 		 204 aa  210  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1914  isochorismatase hydrolase  53.57 
 
 		 222 aa  201  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.652638  normal  0.010767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  33.85 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  34.39 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 329 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  29.13 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  33.51 
 
 		 190 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  33.51 
 
 		 190 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 204 aa  84.7  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  33.51 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  33.51 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  33.51 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  33.51 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  33.51 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  34.17 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  28.17 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  33 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  33.96 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  34.39 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  35.96 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  32.84 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  31.63 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  33.67 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  31.58 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  32.49 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  28.36 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  31.18 
 
 		 533 aa  76.3  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  33.85 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  31.66 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  31.44 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  28.36 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  32.83 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  28.3 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  28.3 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  29.84 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  28.22 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  28.86 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  33.67 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  29.29 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  30.05 
 
 		 231 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  32.83 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4718  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  34.03 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  34.25 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  34.03 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  34.03 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  38.68 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  34.03 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  30.93 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  34.03 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  31.87 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  33.84 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  29.51 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  38.24 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  38.24 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  28.36 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  29.51 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  38.24 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  34.2 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  29.51 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  38.24 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  38.24 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  38.24 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  38.24 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  28.72 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  30.59 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  38.24 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.14 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  30 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  29.03 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>