More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0804 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0804  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 204 aa  411  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1914  isochorismatase hydrolase  89.95 
 
 		 222 aa  341  4e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.652638  normal  0.010767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  55.67 
 
 		 207 aa  224  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5987  putative isochorismatase family protein  55.1 
 
 		 204 aa  220  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104192 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3766  isochorismatase hydrolase  51.55 
 
 		 201 aa  205  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0690  isochorismatase  49.26 
 
 		 200 aa  200  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0385693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  35.11 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  31.6 
 
 		 228 aa  91.3  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  33.64 
 
 		 233 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  37.22 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  36.79 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  29.02 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  35.56 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  35.14 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  35.48 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  35.48 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  33.52 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  33.52 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  34.78 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  35.48 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  33.52 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  33.52 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  29.02 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  35.48 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  33.52 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  35.48 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  31.28 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  35.24 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4718  hypothetical protein  35.82 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  34.95 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  30.1 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  29.59 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  29.59 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  30.21 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  32.24 
 
 		 190 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  29.59 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  29.59 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  32.35 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  34.95 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  29.59 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  39.52 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  31.84 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  32.72 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  32.63 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  30.68 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  31.15 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  25.38 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  31.15 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  31.15 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  31.15 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  31.15 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  31.53 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  31.15 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  31.15 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  38.2 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 		 264 aa  68.2  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  26.82 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  30 
 
 		 533 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  37.7 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  32.63 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  30.1 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  29.05 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  33.49 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  29.28 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>