More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01826 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  100 
 
 
188 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
188 aa  385  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  385  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  98.94 
 
 
188 aa  381  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  98.94 
 
 
188 aa  380  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  80.85 
 
 
188 aa  320  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  80.85 
 
 
188 aa  320  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  80.85 
 
 
188 aa  320  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  80.85 
 
 
188 aa  320  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  80.85 
 
 
188 aa  320  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  73.94 
 
 
188 aa  299  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  67.89 
 
 
192 aa  265  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  58.82 
 
 
199 aa  234  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  59.89 
 
 
199 aa  232  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  50 
 
 
190 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  48.66 
 
 
190 aa  180  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  52.22 
 
 
190 aa  175  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  48.39 
 
 
198 aa  174  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  48.92 
 
 
189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  48.89 
 
 
193 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  47.37 
 
 
199 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  45.6 
 
 
200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  45.6 
 
 
195 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1105  isochorismatase  100 
 
 
84 aa  149  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  45.05 
 
 
195 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  40.74 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  40.74 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  41.94 
 
 
204 aa  137  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  44.97 
 
 
187 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  43.23 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  41.11 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
187 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  41.11 
 
 
187 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  41.76 
 
 
187 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  41.76 
 
 
187 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  41.76 
 
 
187 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  41.21 
 
 
187 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  40.66 
 
 
187 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  39.27 
 
 
185 aa  121  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  35.68 
 
 
200 aa  118  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  40.44 
 
 
187 aa  118  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  37.91 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  40.56 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  36.46 
 
 
166 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  38.12 
 
 
191 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 
197 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  31 
 
 
204 aa  88.6  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  34.54 
 
 
244 aa  86.7  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  26.5 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  31.61 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  33.69 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  31.89 
 
 
218 aa  77  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  29.17 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  30.96 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  30.53 
 
 
389 aa  74.3  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  33.57 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  32.57 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  34.32 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  28.71 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  31.73 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  30.69 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  35.62 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  29.52 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  32.61 
 
 
183 aa  72  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 
213 aa  72  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  35.62 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  32.72 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  35.62 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  35.62 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  35.62 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  35.62 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  31.64 
 
 
241 aa  71.2  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  30.16 
 
 
227 aa  71.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  27.51 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  32.72 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  31.91 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  30.24 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  28.06 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  27.93 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  38.24 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1914  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.652638  normal  0.010767 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  34.93 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  43.59 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>