More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1717 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  84.58 
 
 
201 aa  371  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  93.53 
 
 
201 aa  367  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  85 
 
 
201 aa  358  4e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  57 
 
 
204 aa  235  4e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  57.81 
 
 
199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  53.3 
 
 
196 aa  220  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  50.26 
 
 
203 aa  216  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  51.78 
 
 
214 aa  204  8e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  44.09 
 
 
193 aa  153  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  43.81 
 
 
192 aa  151  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  45.74 
 
 
190 aa  149  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  44.2 
 
 
190 aa  148  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  43.65 
 
 
192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  43.68 
 
 
188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  40.85 
 
 
174 aa  128  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 
172 aa  124  7e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  41.82 
 
 
213 aa  122  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  35.67 
 
 
180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  37.21 
 
 
193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 
176 aa  115  5e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  36.16 
 
 
212 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 
209 aa  102  5e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  33.5 
 
 
231 aa  101  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  33 
 
 
230 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  34.46 
 
 
227 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  33 
 
 
231 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  33 
 
 
231 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  33 
 
 
230 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  32 
 
 
248 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1859  isochorismatase hydrolase  37.08 
 
 
179 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  33 
 
 
231 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
233 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 
227 aa  99  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 
231 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  32.7 
 
 
241 aa  96.7  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  32.5 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 
176 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  28.26 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4541  isochorismatase hydrolase  31.35 
 
 
179 aa  95.5  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366879  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  34.59 
 
 
189 aa  94  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  35.64 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  29.5 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1614  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 
187 aa  92.8  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  32.16 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3544  isochorismatase hydrolase  37.13 
 
 
179 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3617  isochorismatase hydrolase  37.13 
 
 
179 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3549  isochorismatase hydrolase  37.13 
 
 
179 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  27.72 
 
 
179 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 
240 aa  91.7  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 
329 aa  91.7  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  32.4 
 
 
244 aa  91.7  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  34.76 
 
 
174 aa  90.1  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  27.17 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2002  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 
202 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0995803  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  33.86 
 
 
239 aa  89  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  29.8 
 
 
264 aa  89  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  37.66 
 
 
204 aa  88.6  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  27.17 
 
 
179 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  27.17 
 
 
179 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  33.67 
 
 
246 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 
174 aa  88.2  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 
195 aa  88.2  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  32.62 
 
 
233 aa  88.2  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 
239 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  27.17 
 
 
179 aa  88.2  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  27.17 
 
 
179 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 
204 aa  87.8  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 
201 aa  87.8  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  27.17 
 
 
179 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  27.72 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 
245 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 
217 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  34.84 
 
 
205 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 
230 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
230 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 
236 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0918  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 
194 aa  86.3  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.509433  normal  0.0420596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  33.16 
 
 
274 aa  85.5  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 
228 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 
213 aa  85.9  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
185 aa  85.9  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  31.49 
 
 
228 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0853  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 
194 aa  84.7  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 
241 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  31.95 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 
189 aa  84  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  32.28 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  32.63 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  32.57 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  31.07 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  32.07 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  29.79 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  35.79 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  31.35 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>