More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0664 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  67.65 
 
 		 204 aa  301  4.0000000000000003e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  68.84 
 
 		 201 aa  300  9e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  66.35 
 
 		 213 aa  300  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  70.62 
 
 		 205 aa  294  7e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  64.45 
 
 		 213 aa  285  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  59.6 
 
 		 213 aa  254  6e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  54.27 
 
 		 214 aa  231  5e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11593  hypothetical protein  35.52 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.277049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  31.34 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0874  isochorismatase hydrolase  27.69 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  30.99 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  32.11 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2596  hypothetical protein  29.9 
 
 		 196 aa  98.2  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  31.44 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  35.79 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  31.58 
 
 		 227 aa  95.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  30.93 
 
 		 230 aa  95.1  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  25.85 
 
 		 377 aa  95.1  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  32.42 
 
 		 533 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 		 247 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  31.31 
 
 		 193 aa  92  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1030  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 203 aa  91.7  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 199 aa  91.7  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 234 aa  91.3  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  32.11 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  30.65 
 
 		 228 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  30.43 
 
 		 233 aa  88.6  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 239 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 239 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  32.95 
 
 		 230 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 231 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  27.69 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  32.95 
 
 		 230 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  30.69 
 
 		 389 aa  87  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  32.95 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  32.95 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  31.77 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  33.52 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5191  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  29.13 
 
 		 207 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 		 240 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  29.1 
 
 		 231 aa  85.5  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  32.39 
 
 		 231 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 		 227 aa  85.1  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 192 aa  84.7  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  29.1 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  29.84 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  30.68 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  30.18 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  27.53 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  33.18 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3766  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  29.84 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  29.69 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  29.76 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  28.64 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  27.64 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5987  putative isochorismatase family protein  28.65 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C36  amidase  30.77 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  27.46 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  29.84 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  28.42 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  29.67 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  30.98 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  30.98 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  30.98 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  30.98 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>