More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1314 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
172 aa  351  2e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  43.68 
 
 
180 aa  148  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  38.86 
 
 
193 aa  132  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  40.35 
 
 
203 aa  130  9e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  35.47 
 
 
201 aa  122  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 
196 aa  122  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  34.88 
 
 
201 aa  121  6e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 
188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 
201 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 
201 aa  115  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  35.88 
 
 
199 aa  113  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  36.21 
 
 
174 aa  105  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
176 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  35.63 
 
 
174 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  35.63 
 
 
174 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  36.09 
 
 
192 aa  100  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 
192 aa  99.4  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 
193 aa  99  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  35.36 
 
 
192 aa  98.2  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 
190 aa  97.4  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0871  isochorismatase hydrolase  34.86 
 
 
178 aa  95.9  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.317325  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  34.15 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1659  isochorismatase hydrolase  35.96 
 
 
180 aa  94.7  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.262359  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  30.36 
 
 
213 aa  94  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  32 
 
 
176 aa  93.6  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  32.07 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 
188 aa  91.7  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 
190 aa  89.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  30.88 
 
 
208 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
189 aa  84.7  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  33.15 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  32.42 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  29.9 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  32.42 
 
 
182 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  32.97 
 
 
182 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 
184 aa  82  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  28.07 
 
 
195 aa  80.9  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 
183 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  32.04 
 
 
184 aa  80.9  0.000000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  32.42 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  32.42 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  32.42 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  30.56 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  31.87 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  31.87 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  31.67 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  31.67 
 
 
182 aa  79  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  34.85 
 
 
195 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  28.32 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  31.03 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0323  nicotinamidase/ pyrazinamidase  29.13 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  31.03 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  31.03 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  35.14 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0345  nicotinamidase/ pyrazinamidase  29.13 
 
 
206 aa  77.4  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  31.31 
 
 
197 aa  77.4  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  30.23 
 
 
197 aa  77.4  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  27.94 
 
 
216 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 
201 aa  77.4  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  28.02 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 
193 aa  77  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 
193 aa  77  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  31.53 
 
 
240 aa  77  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  28.93 
 
 
210 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  28.64 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1444  Nicotinamidase  28.78 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0368636  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3125  nicotinamidase  26.96 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0352005  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  25.53 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1614  isochorismatase hydrolase  28.9 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  27.12 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  34.34 
 
 
200 aa  74.3  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  29.61 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2454  pyrazinamidase/nicotinamidase  28.71 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  29.59 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  26.4 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2332  pyrazinamidase/nicotinamidase  28.71 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2293  pyrazinamidase/nicotinamidase  28.71 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  27.84 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  29.38 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  31.02 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1437  pyrazinamidase/nicotinamidase  28.71 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00306349  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2143  pyrazinamidase/nicotinamidase  31.28 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4541  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366879  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1927  pyrazinamidase/nicotinamidase  28.71 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1200  pyrazinamidase/nicotinamidase  28.71 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694975  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3377  pyrazinamidase/nicotinamidase  28.71 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>