More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3116 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 224 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  35.55 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  33.02 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  33.02 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  33.02 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  33.02 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  33.02 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  33.02 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  32.56 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  32.56 
 
 		 231 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  35.24 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  32.54 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  33.33 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  33.49 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  36.32 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  34.33 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  29.91 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  35.96 
 
 		 258 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  34.29 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 239 aa  99  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 233 aa  97.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  33.17 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  34.47 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  35.61 
 
 		 252 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  32.35 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  31.8 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  31.92 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 		 266 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  34.3 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  35.98 
 
 		 232 aa  91.7  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  31.58 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  31.71 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  34.39 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  35.32 
 
 		 247 aa  89  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  33.98 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  34.87 
 
 		 248 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  33.85 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  30.24 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 		 247 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  33.69 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 213 aa  85.1  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  27.67 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  30.1 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  30.21 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  36.18 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  37.58 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  31.1 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  34 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  33.17 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 		 329 aa  82  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  35.61 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  31.37 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  31.37 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1827  isochorismatase hydrolase  31.37 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  30.81 
 
 		 533 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  34.3 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  36.1 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  31.5 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4718  hypothetical protein  34.69 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  32.06 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  34.63 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  33.7 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  35.33 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2624  isochorismatase hydrolase  32.74 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.722886  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  30.92 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  30 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  33.66 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  25.53 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  27.67 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  28.88 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  29.77 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  32.8 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.53 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>