More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2928 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  56.59 
 
 		 190 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  52.51 
 
 		 195 aa  185  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  49.71 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  49.71 
 
 		 189 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  43.48 
 
 		 188 aa  147  9e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  43.32 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  37.93 
 
 		 235 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  41.14 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  35.39 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  41.36 
 
 		 197 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2022  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 221 aa  95.9  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85317  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  34.42 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 		 196 aa  91.7  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 203 aa  88.6  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  38.06 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  37.66 
 
 		 201 aa  88.2  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  37.66 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 189 aa  85.9  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  35.4 
 
 		 224 aa  84.7  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  37.22 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  32.48 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  30.85 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  33.33 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  36.46 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  36.42 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  30.54 
 
 		 389 aa  81.3  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  33.82 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  35.87 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  32.56 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  35.06 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  29.06 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  36.23 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  33.13 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  35.09 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  33.33 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  31.35 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  34.94 
 
 		 329 aa  78.2  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  35.14 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  30.93 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  33.8 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  29.06 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  35.33 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  31.4 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  29.1 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  27.75 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  25.65 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  32.96 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 239 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01880  nicotinamidase-like amidase  34.12 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  28.11 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  27.23 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1859  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  36.6 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 		 226 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  34.39 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  31.43 
 
 		 247 aa  72  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 		 232 aa  72  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 248 aa  72  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  27.84 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  27.03 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  29.57 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  30.05 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  30.05 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  34.52 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  30.05 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  33.79 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  32.9 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  32.16 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>