More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1849 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 231 aa  471  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  91.03 
 
 		 224 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  79.9 
 
 		 216 aa  332  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  73.91 
 
 		 215 aa  309  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  73.91 
 
 		 215 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  73.91 
 
 		 215 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  74.26 
 
 		 208 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  74.36 
 
 		 211 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  74.87 
 
 		 223 aa  300  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  64.71 
 
 		 213 aa  274  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  42.16 
 
 		 210 aa  164  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  43.59 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  42.78 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  44.28 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  44.28 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  47.45 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  44.28 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  42.86 
 
 		 213 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  40.5 
 
 		 216 aa  141  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  43.78 
 
 		 213 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  39.68 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  39.57 
 
 		 209 aa  131  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  42.53 
 
 		 209 aa  128  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  38.16 
 
 		 207 aa  128  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  34.87 
 
 		 218 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  44.81 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  37.26 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  40.76 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  32.51 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  33.18 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  31.8 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  37.82 
 
 		 212 aa  92.8  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  31.65 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  30.5 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  35.45 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  34.68 
 
 		 195 aa  85.1  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  30.04 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  36.46 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 187 aa  81.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  31.82 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  37.8 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  37.14 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  32.12 
 
 		 231 aa  72  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 189 aa  72  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  27.98 
 
 		 180 aa  71.2  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  35.19 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  31.09 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  31.93 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  31.64 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  33.13 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  29.09 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  32.56 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  32.24 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  34.03 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  32.73 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  32.91 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  31.09 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  32.91 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  31.05 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  35.1 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  26.97 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1030  isochorismatase hydrolase  30.72 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  33.99 
 
 		 202 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  32.73 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  28.81 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0688  isochorismatase hydrolase  29.1 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  30.72 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  29.94 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  26.7 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  30.59 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_8142  predicted protein  46.15 
 
 		 96 aa  64.3  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  36.08 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  36.96 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  30.59 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  35.14 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  26.83 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>