More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1817 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 189 aa  376  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  54.59 
 
 		 189 aa  191  8e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  54.14 
 
 		 189 aa  175  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  47.83 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  47.89 
 
 		 195 aa  164  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  47.31 
 
 		 197 aa  153  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  57.82 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  43.82 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  43.26 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  44.38 
 
 		 198 aa  121  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  41.3 
 
 		 226 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3668  isochorismatase hydrolase  36.02 
 
 		 243 aa  104  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.856402 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6682  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0364  putative isochorismate hydrolase  33.92 
 
 		 223 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 211 aa  98.6  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4198  isochorismatase hydrolase  33.68 
 
 		 189 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4618  isochorismatase hydrolase  35.09 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5005  putative isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 189 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3979  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 189 aa  94.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3865  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 189 aa  94.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.282134 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0745  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 		 211 aa  94.4  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955139 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  36.72 
 
 		 185 aa  93.6  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  32.42 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0201  isochorismatase hydrolase  35.18 
 
 		 198 aa  92  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  39.37 
 
 		 194 aa  91.3  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  35.6 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  39.6 
 
 		 210 aa  88.6  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  35.39 
 
 		 215 aa  88.2  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 204 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  33.16 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  33.16 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  33.16 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  33.16 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  33.16 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  32.86 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  34.76 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  36.57 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  31.05 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  35.48 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  35.87 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  36.52 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  36.5 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  31.17 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  30.52 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  34.9 
 
 		 239 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  31.35 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  30.18 
 
 		 235 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  33.1 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 		 207 aa  77.8  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  33.69 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  34.9 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  31.15 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  36.61 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  34.31 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  30.96 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  32.88 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  35.17 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  34.87 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  27.89 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  27.89 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  30.96 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  30.96 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  30.96 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  30.96 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  30.96 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  30.96 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  33.53 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  31.08 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  32.82 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  30.05 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  32.04 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4714  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  34.01 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  33.12 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>