More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0173 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 209 aa  424  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  56.72 
 
 		 242 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  56.99 
 
 		 215 aa  211  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  50.72 
 
 		 211 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  56.65 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  50.25 
 
 		 213 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  50.5 
 
 		 213 aa  203  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  50.5 
 
 		 213 aa  203  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  53.61 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  50.73 
 
 		 210 aa  202  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  50.25 
 
 		 213 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  50.24 
 
 		 214 aa  196  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  47.76 
 
 		 213 aa  187  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  48.42 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  47.54 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  41.43 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  41.58 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  40.72 
 
 		 208 aa  138  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  39.3 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  39.57 
 
 		 231 aa  131  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  41.01 
 
 		 223 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  40.45 
 
 		 215 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  39.89 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  39.89 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  46.99 
 
 		 198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  39.13 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  38.66 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  39.44 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  34.33 
 
 		 247 aa  115  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  35.87 
 
 		 227 aa  111  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  35.98 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  35.96 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  34.09 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  32.85 
 
 		 221 aa  98.6  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  32.42 
 
 		 252 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  35.52 
 
 		 187 aa  85.9  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  35.95 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  33.99 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  29.26 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  35.53 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  38.61 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  30.85 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  34.51 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  31.45 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  31.89 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  26.6 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  31.06 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  27.86 
 
 		 228 aa  72  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  29.81 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  34.19 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  26.84 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  30.18 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  30.18 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  30.18 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  30.18 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  30.18 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  33.11 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  26.74 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  34.21 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  32.28 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  29.88 
 
 		 172 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  29.12 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  27.46 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  29.34 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  30.65 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  29.12 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  27.81 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  31.18 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  31.08 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  31.08 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  31.08 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  29.56 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6682  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>