More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0181 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 247 aa  510  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  75.71 
 
 		 247 aa  400  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  66.24 
 
 		 243 aa  315  5e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  41.71 
 
 		 217 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  41.71 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  37.31 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  40.49 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  41.24 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  34.13 
 
 		 235 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  33 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  33.17 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  32.52 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  30.58 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 196 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  32.53 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 		 222 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  30.72 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  31.17 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  27.94 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  32.05 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  32.3 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5987  putative isochorismatase family protein  29.58 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104192 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  25.11 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  29.81 
 
 		 209 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  32.91 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  27.88 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  27.94 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  32.1 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2011  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177964 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  34.62 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  29.47 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  32.48 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  32.48 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  32.48 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.45 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  28.08 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  27.59 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  32.48 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  26.52 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  31.75 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  30.26 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  27.5 
 
 		 235 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  30.34 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  28.29 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  30.77 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  34.23 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  27.53 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  25.96 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  30.82 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  26.49 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  29.13 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  33.96 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  27.49 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  31.65 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  27.38 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  28.67 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  28 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  28.16 
 
 		 187 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  28.16 
 
 		 187 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  31.47 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  29.05 
 
 		 181 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  32.81 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  27.94 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  29.91 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  27.94 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  27.94 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  27.87 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  27.94 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  27.94 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  30.82 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  32.84 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  29.17 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>