266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2011 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2011  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
204 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.177964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4334  isochorismatase hydrolase  84.24 
 
 
207 aa  318  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366283  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1787  isochorismatase hydrolase  78 
 
 
207 aa  291  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1834  isochorismatase hydrolase  78 
 
 
207 aa  291  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1768  isochorismatase hydrolase  77.5 
 
 
207 aa  289  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.470153  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8742  isochorismatase hydrolase  50.72 
 
 
235 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3647  isochorismatase hydrolase  45.99 
 
 
211 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0439304  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1996  isochorismatase hydrolase  44.23 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4162  isochorismatase hydrolase  42.19 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4119  isochorismatase hydrolase  41.75 
 
 
211 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  27 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  28.27 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  34.1 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
247 aa  68.6  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  26.15 
 
 
533 aa  68.2  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  25.25 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  33.06 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  25.91 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  26.44 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  26.59 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  32.72 
 
 
227 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  25.39 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  28.27 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  33.88 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 
222 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 
226 aa  61.6  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  25.65 
 
 
222 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  26.88 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  31.54 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  28.32 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  29.05 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 
180 aa  60.5  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  26.06 
 
 
243 aa  59.7  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7071  isochorismatase hydrolase  29.69 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00539023  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  29.05 
 
 
217 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  28.88 
 
 
232 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  25.54 
 
 
213 aa  58.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  27.38 
 
 
201 aa  58.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  27.39 
 
 
188 aa  58.2  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  33.33 
 
 
214 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  27.78 
 
 
231 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  34.15 
 
 
227 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  25.68 
 
 
234 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  25.29 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  27.52 
 
 
230 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  24.74 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6174  isochorismatase hydrolase  29.34 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.122012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  29.51 
 
 
227 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  27.52 
 
 
231 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  27.52 
 
 
231 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  27.52 
 
 
230 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5128  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 
220 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  29.08 
 
 
239 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  27.52 
 
 
231 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  28.11 
 
 
231 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  29.08 
 
 
196 aa  54.7  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  23.17 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  28.91 
 
 
241 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  27.03 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  27.66 
 
 
239 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  27.33 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  31.78 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  30.25 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  27.08 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  34.23 
 
 
224 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  23.12 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  26.39 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  27.85 
 
 
231 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  26.55 
 
 
266 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  28.99 
 
 
233 aa  52.8  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  25 
 
 
228 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  25.48 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  25.48 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  25.48 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
200 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1030  isochorismatase hydrolase  26.4 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
187 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  26.18 
 
 
195 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  26.83 
 
 
389 aa  52  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  31.06 
 
 
197 aa  52  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 
187 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  27.04 
 
 
187 aa  51.6  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  25.19 
 
 
234 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  25.54 
 
 
225 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  26.95 
 
 
190 aa  51.6  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  25 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  22.06 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  32.41 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>