More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6174 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6174  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
196 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.122012 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  49.46 
 
 
193 aa  197  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  49.46 
 
 
193 aa  197  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  49.46 
 
 
193 aa  197  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  42.6 
 
 
195 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  28.93 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  43.3 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  34.68 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  24.44 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  33.56 
 
 
227 aa  68.2  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  27.27 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  34.29 
 
 
197 aa  67  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  34.81 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  25.27 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.62 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  34.75 
 
 
233 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  32.65 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 
174 aa  62.4  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 
224 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  33.04 
 
 
181 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  32.87 
 
 
264 aa  62  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  32.17 
 
 
181 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  32.48 
 
 
316 aa  61.6  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  31.34 
 
 
228 aa  61.6  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 
201 aa  61.6  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  31.16 
 
 
258 aa  61.2  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  30.32 
 
 
359 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3647  isochorismatase hydrolase  29.45 
 
 
211 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0439304  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  29.5 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  33.03 
 
 
313 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  44.74 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  32.89 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  38.14 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  30.97 
 
 
359 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  31.86 
 
 
266 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  30.52 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  29.85 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  26.34 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  26.04 
 
 
235 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
189 aa  59.3  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  43.75 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  26.37 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
188 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  31.31 
 
 
187 aa  59.3  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  38.39 
 
 
193 aa  59.7  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  26.67 
 
 
195 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  49.18 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  46.97 
 
 
231 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  31.82 
 
 
176 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  30.52 
 
 
176 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  31.82 
 
 
176 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  31.82 
 
 
176 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
179 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  46.97 
 
 
231 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  28.02 
 
 
244 aa  58.9  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  43.33 
 
 
228 aa  58.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  26.35 
 
 
179 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  27.03 
 
 
200 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  27.03 
 
 
195 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  27.35 
 
 
246 aa  58.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 
215 aa  58.5  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  31.58 
 
 
176 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  30.14 
 
 
217 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  34.07 
 
 
230 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  34.07 
 
 
231 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  46.67 
 
 
231 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 
231 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  34.07 
 
 
231 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  34.07 
 
 
231 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  34.07 
 
 
230 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 
230 aa  57.8  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 
181 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  31.37 
 
 
227 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
179 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  33.33 
 
 
179 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
179 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  27.63 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 
209 aa  57.4  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  26.11 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 
185 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
179 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  26.42 
 
 
217 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 
231 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  32.74 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  27.27 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  45 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  27.7 
 
 
179 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  27.27 
 
 
187 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  32.52 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
258 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  27.63 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  31.21 
 
 
214 aa  56.6  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>