More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2229 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  100 
 
 
195 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  96.92 
 
 
200 aa  380  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  96.92 
 
 
195 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  45.73 
 
 
204 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  47.09 
 
 
193 aa  168  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  49.44 
 
 
190 aa  161  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  47.31 
 
 
188 aa  160  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  47.54 
 
 
192 aa  157  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  45.41 
 
 
187 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  45.41 
 
 
187 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  45.41 
 
 
187 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  45.86 
 
 
188 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  45.86 
 
 
188 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  45.86 
 
 
188 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  45.86 
 
 
188 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  45.86 
 
 
188 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  45.41 
 
 
187 aa  155  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  43.23 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  42.33 
 
 
190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  43.88 
 
 
187 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  45.05 
 
 
188 aa  149  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  45.05 
 
 
188 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  45.05 
 
 
188 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  45.05 
 
 
188 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  45.05 
 
 
188 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  45.05 
 
 
188 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  43.37 
 
 
187 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  45.05 
 
 
188 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  44.26 
 
 
199 aa  148  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  45.05 
 
 
188 aa  147  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  42.27 
 
 
191 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  43.72 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  43.81 
 
 
187 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  44.62 
 
 
189 aa  141  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  43.3 
 
 
187 aa  141  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  40.88 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  38.92 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  44.51 
 
 
199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  39.47 
 
 
185 aa  139  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  41.9 
 
 
198 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  40.54 
 
 
187 aa  137  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  43.68 
 
 
185 aa  130  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  41.92 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  38.12 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  38.12 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  36.08 
 
 
187 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  41.01 
 
 
166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  35.39 
 
 
187 aa  92.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  30.96 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  34.52 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  44.66 
 
 
201 aa  77.8  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  31.75 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  29.77 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  37.96 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  31.12 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  41.44 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  37.07 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  41.44 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  30.93 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  41.44 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  33.33 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  28.02 
 
 
227 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 
224 aa  71.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 
187 aa  71.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  29.1 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  27.86 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  28.57 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  32.28 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  29.19 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  29.79 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  30.82 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  28.98 
 
 
247 aa  68.2  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 
217 aa  67.8  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  40.23 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  43.42 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  39.6 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  31.37 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  36.61 
 
 
227 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  31.53 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  35.96 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  31.86 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  25.71 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  30.07 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>