More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1769 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 189 aa  374  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  64.89 
 
 		 190 aa  253  8e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  51.61 
 
 		 192 aa  194  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  52.15 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  51.32 
 
 		 199 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  48.68 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  48.92 
 
 		 188 aa  174  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  48.92 
 
 		 188 aa  174  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  48.92 
 
 		 188 aa  174  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  48.92 
 
 		 188 aa  174  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  48.92 
 
 		 188 aa  174  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  48.92 
 
 		 188 aa  174  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  45.7 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  45.7 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  45.7 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  45.7 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  45.7 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  46.24 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  47.85 
 
 		 193 aa  154  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  47.54 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  48.31 
 
 		 199 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  43.24 
 
 		 190 aa  148  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  44.26 
 
 		 195 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  44.26 
 
 		 200 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  44.81 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  41.4 
 
 		 190 aa  137  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  43.32 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  40.56 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  44.09 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  43.82 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  40.86 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  44.63 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  44.63 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  44.63 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  43.02 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  40.45 
 
 		 187 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  41.86 
 
 		 187 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  39.15 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  35.33 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  39.44 
 
 		 187 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  41.92 
 
 		 187 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  42.94 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  42.05 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  35.05 
 
 		 201 aa  96.3  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  38.2 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  35.11 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  33.33 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  38.62 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  34.24 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  31.55 
 
 		 195 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  34.22 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  38.51 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  30.41 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  33.68 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  31.1 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  35.91 
 
 		 180 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  36.64 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  35.53 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  30.89 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  47.89 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  30.96 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  34.44 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1914  isochorismatase hydrolase  34.3 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.652638  normal  0.010767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4146  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0661023  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  32.81 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  26.26 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  30.66 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  31.91 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  27.93 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  49.21 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5987  putative isochorismatase family protein  35.66 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  49.21 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  49.21 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  31.09 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3766  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0804  isochorismatase hydrolase  35.65 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  31.09 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 239 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  24.2 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 227 aa  64.3  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>