More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2098 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  100 
 
 		 188 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  87.1 
 
 		 188 aa  344  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1215  isochorismatase hydrolase  63.39 
 
 		 185 aa  249  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0688  isochorismatase hydrolase  59.76 
 
 		 184 aa  219  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  58.52 
 
 		 191 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  56.11 
 
 		 193 aa  204  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  54.44 
 
 		 193 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  43.17 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  41.81 
 
 		 195 aa  146  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  40.11 
 
 		 184 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  40.11 
 
 		 184 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  39.01 
 
 		 184 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  39.56 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  39.56 
 
 		 184 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  39.56 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  41.24 
 
 		 184 aa  141  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  40.11 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  42.29 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  40.11 
 
 		 184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  37.99 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  39.56 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 		 190 aa  127  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  40.45 
 
 		 176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  35.87 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 		 185 aa  94.4  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  31.84 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  31.84 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  31.84 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  31.28 
 
 		 187 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  31.84 
 
 		 187 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  31.28 
 
 		 187 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  31.84 
 
 		 187 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  32.43 
 
 		 210 aa  90.5  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  30.9 
 
 		 181 aa  89  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  31.46 
 
 		 181 aa  89  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  35.14 
 
 		 184 aa  89  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 182 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 223 aa  87.8  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  34.25 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  28.25 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 181 aa  86.3  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  30.51 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 		 182 aa  84.3  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  27.12 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03429  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12220)  30.59 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.422147  normal  0.109574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  32.18 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  30.11 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2494  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  27.78 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  28.81 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  28.98 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  35.66 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2520  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1968  isochorismatase hydrolase  27.96 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  0.0178408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1463  isochorismatase hydrolase  32.28 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3001  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 		 202 aa  72  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  29.53 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  31.61 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  31.91 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  30.51 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0095  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  25.84 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>