164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4146 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4146  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 183 aa  373  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0661023  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0155  hypothetical protein  81.95 
 
 		 135 aa  229  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586581  normal  0.969052 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6682  isochorismatase hydrolase  40.24 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5005  putative isochorismatase hydrolase  40.94 
 
 		 189 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3979  isochorismatase hydrolase  39.33 
 
 		 189 aa  111  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  40.46 
 
 		 217 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  40.46 
 
 		 217 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3865  isochorismatase hydrolase  39.33 
 
 		 189 aa  111  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.282134 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  40.46 
 
 		 217 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3668  isochorismatase hydrolase  41.52 
 
 		 243 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.856402 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  41.04 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0364  putative isochorismate hydrolase  39.53 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  40.46 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4198  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4618  isochorismatase hydrolase  39.77 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0745  isochorismatase hydrolase  39.77 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  33.33 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  33.73 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  52.05 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  31.03 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  29.94 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  25.86 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  36.27 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  29.07 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  26.23 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  27.75 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  27.5 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  28.85 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  28.03 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  28.03 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  28.03 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  24.02 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  28.05 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4714  isochorismatase hydrolase  41.07 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  27.33 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  36.23 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  36.23 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  36.23 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  36.23 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  36.23 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  36.23 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  36.23 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  30.53 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  30.53 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  36.23 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  27.21 
 
 		 235 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  28.21 
 
 		 187 aa  52.4  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 		 166 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  26.71 
 
 		 187 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  29.61 
 
 		 241 aa  51.2  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  33.75 
 
 		 228 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  35.09 
 
 		 248 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  35.09 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  35.09 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  28.37 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  25.32 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  33.33 
 
 		 230 aa  48.9  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  35.96 
 
 		 258 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  29.01 
 
 		 244 aa  48.5  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 237 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  25.9 
 
 		 200 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  26.53 
 
 		 195 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  24.05 
 
 		 188 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  24.05 
 
 		 188 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  24.05 
 
 		 188 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  24.05 
 
 		 188 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  24.05 
 
 		 188 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  24.05 
 
 		 188 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  32.5 
 
 		 228 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 266 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  38.75 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  23.75 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  24.1 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  36.36 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  37.1 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  25.3 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  25.87 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  23.78 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  24.58 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  23.42 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  34.52 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  25.45 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  22.29 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  22.29 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  22.29 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  22.29 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>