162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0155 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0155  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  275  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586581  normal  0.969052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4146  isochorismatase hydrolase  81.95 
 
 		 183 aa  229  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0661023  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6682  isochorismatase hydrolase  42.11 
 
 		 212 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4198  isochorismatase hydrolase  55.84 
 
 		 189 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3979  isochorismatase hydrolase  55.84 
 
 		 189 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  43.28 
 
 		 211 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3865  isochorismatase hydrolase  55.84 
 
 		 189 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.282134 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  40.77 
 
 		 217 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  40.77 
 
 		 217 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  41.35 
 
 		 211 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3668  isochorismatase hydrolase  41.35 
 
 		 243 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.856402 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  40.77 
 
 		 217 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4618  isochorismatase hydrolase  57.89 
 
 		 218 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0364  putative isochorismate hydrolase  55.26 
 
 		 223 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5005  putative isochorismatase hydrolase  55.84 
 
 		 189 aa  90.5  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0745  isochorismatase hydrolase  41.98 
 
 		 211 aa  89.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955139 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  49.35 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  31.65 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  50.68 
 
 		 197 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  38.33 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  40.74 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  34.06 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  40.79 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  33.88 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 187 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  32.56 
 
 		 190 aa  57  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  38.04 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  37.04 
 
 		 213 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  37.68 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  37.68 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  37.68 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  37.68 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  37.68 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  37.68 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  37.68 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4714  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 196 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  37.68 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  38.16 
 
 		 241 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  38.67 
 
 		 200 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  32.97 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  34.15 
 
 		 228 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  32.43 
 
 		 230 aa  51.6  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  28 
 
 		 192 aa  50.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  32.89 
 
 		 231 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 		 235 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  43.24 
 
 		 258 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  37.08 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  32.93 
 
 		 228 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  40.54 
 
 		 215 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  32 
 
 		 230 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 230 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 		 234 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  34.57 
 
 		 213 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 213 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  35 
 
 		 223 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  40.54 
 
 		 213 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 213 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 		 232 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  27.2 
 
 		 186 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  27.2 
 
 		 186 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 		 187 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  43.75 
 
 		 224 aa  47  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  38.24 
 
 		 231 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  37.31 
 
 		 204 aa  47  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  37.93 
 
 		 208 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  47.17 
 
 		 248 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  35.79 
 
 		 231 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  43.75 
 
 		 231 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  47.17 
 
 		 248 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 231 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  37.8 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  44.26 
 
 		 218 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  31.37 
 
 		 223 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  29.33 
 
 		 227 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 266 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  47.17 
 
 		 247 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 228 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  30.83 
 
 		 222 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1030  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 227 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 221 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  29.2 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  31.09 
 
 		 229 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  29.2 
 
 		 199 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  32.88 
 
 		 199 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  37.5 
 
 		 274 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  30.11 
 
 		 188 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2494  isochorismatase hydrolase  40.68 
 
 		 198 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  30.11 
 
 		 188 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  30.11 
 
 		 188 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  30.11 
 
 		 188 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  32.56 
 
 		 201 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  30.11 
 
 		 188 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>