More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2669 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
186 aa  376  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
186 aa  376  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  43.48 
 
 
189 aa  154  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  43.17 
 
 
189 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  44.57 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  37.16 
 
 
186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  35.29 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 
174 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  34.5 
 
 
195 aa  97.8  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 
197 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  31.49 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  27.03 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3668  isochorismatase hydrolase  31.71 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.856402 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  28.49 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5005  putative isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454976  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6682  isochorismatase hydrolase  29.88 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3865  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.282134 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  29.27 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3979  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627608  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  29.57 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  29.1 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  29.24 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  29.24 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  29.24 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  25.47 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  26.04 
 
 
240 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  30.57 
 
 
210 aa  72  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 
187 aa  72  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  27.65 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  27.89 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  28.66 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0364  putative isochorismate hydrolase  27.88 
 
 
223 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 
237 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  25.14 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  30.94 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  30.14 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  30.94 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  30.94 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  30.14 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  30.94 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  30.94 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  27.27 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  27.27 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  27.68 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4198  isochorismatase hydrolase  28.14 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  27.68 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  27.68 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  27.68 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  27.68 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  27.68 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  27.68 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  27.68 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  26.34 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0745  isochorismatase hydrolase  28.83 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955139 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  31.58 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  31.35 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  25.27 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  27.84 
 
 
285 aa  68.2  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  25.95 
 
 
227 aa  68.2  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  27.27 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  23.12 
 
 
232 aa  68.2  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5128  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 
220 aa  67.8  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 
223 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 
216 aa  67  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 
187 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  28.83 
 
 
218 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  25.81 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  27.47 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  27.32 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  27.32 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  27.32 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  28.98 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  27.32 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  26.79 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  25.98 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  27.32 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  26.34 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  28.1 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  27.37 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  24.6 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>