More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2180 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 190 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  64.89 
 
 		 189 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  58.6 
 
 		 192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  54.84 
 
 		 199 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  56.67 
 
 		 199 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  52.22 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  52.22 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  52.22 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  52.22 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  52.22 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  52.22 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  52.22 
 
 		 188 aa  174  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  51.67 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  50.56 
 
 		 188 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  50.56 
 
 		 188 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  50.56 
 
 		 188 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  50.56 
 
 		 188 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  50.56 
 
 		 188 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  50.56 
 
 		 195 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  50.56 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  48.7 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  49.44 
 
 		 195 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  49.46 
 
 		 193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  49.44 
 
 		 199 aa  156  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  45.9 
 
 		 190 aa  151  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  45.2 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  40.93 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  41.58 
 
 		 200 aa  131  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  46.47 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  46.47 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  46.47 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  45.4 
 
 		 166 aa  128  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  40.86 
 
 		 187 aa  128  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  45.88 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  43.26 
 
 		 191 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  44.12 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  44.12 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  43.86 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  39.89 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  39.89 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  39.78 
 
 		 188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  45.56 
 
 		 187 aa  118  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  45.51 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  42.94 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  40.83 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  36.02 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 201 aa  98.2  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 		 213 aa  87  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  35.08 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  30.93 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  29.29 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  30.26 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  29.85 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1914  isochorismatase hydrolase  34.68 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.652638  normal  0.010767 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  36.69 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  29.38 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  36.69 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  32.34 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 		 224 aa  72  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 244 aa  72  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  35.26 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  36.09 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  36.09 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  33.73 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  31.69 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5987  putative isochorismatase family protein  29.63 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104192 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  29.8 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  33.55 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  32.19 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 246 aa  68.2  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  27.57 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  34.33 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  29.9 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  32 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0804  isochorismatase hydrolase  35.85 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>