More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1712 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  100 
 
 
187 aa  380  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  64.86 
 
 
187 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  64.86 
 
 
187 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  64.86 
 
 
187 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  64.32 
 
 
187 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  63.24 
 
 
187 aa  251  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  63.24 
 
 
187 aa  248  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  61.62 
 
 
187 aa  245  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  61.41 
 
 
187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  59.89 
 
 
191 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  60.87 
 
 
187 aa  229  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  58.7 
 
 
185 aa  218  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  59.68 
 
 
187 aa  218  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  58.47 
 
 
188 aa  209  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  51.69 
 
 
185 aa  189  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  51.35 
 
 
193 aa  180  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  41.14 
 
 
190 aa  140  9e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  40.88 
 
 
190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  41.5 
 
 
204 aa  136  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  37.84 
 
 
200 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  37.84 
 
 
195 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  39.67 
 
 
188 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  36.08 
 
 
195 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  38.12 
 
 
198 aa  120  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  39.89 
 
 
188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  39.89 
 
 
188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  39.89 
 
 
188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  39.89 
 
 
188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  39.89 
 
 
188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  40.44 
 
 
188 aa  118  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  40.44 
 
 
188 aa  118  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  40.44 
 
 
188 aa  118  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  40.44 
 
 
188 aa  118  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  40.44 
 
 
188 aa  118  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  40.44 
 
 
188 aa  118  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  40.22 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  40.44 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  40.22 
 
 
199 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  39.34 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  40.83 
 
 
190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  39.23 
 
 
192 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 
185 aa  106  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 
185 aa  106  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  38.89 
 
 
189 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 
199 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  30.11 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 
166 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  35 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  29.35 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  34.59 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  31.06 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  29.45 
 
 
218 aa  72  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  28.32 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  28.18 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4714  isochorismatase hydrolase  35 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  32.87 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  35.66 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1215  isochorismatase hydrolase  35.81 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  34.81 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  36.36 
 
 
196 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  29.11 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  34.75 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  34.23 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  39.8 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  30.68 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  32.41 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  29.1 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3130  isochorismatase hydrolase  32.88 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.361806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  26.42 
 
 
184 aa  62.8  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  40.21 
 
 
201 aa  62.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  25.52 
 
 
164 aa  62.8  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  31.51 
 
 
177 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  32.19 
 
 
177 aa  62  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  26.46 
 
 
189 aa  62  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 
184 aa  62  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  40 
 
 
258 aa  62  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  36.71 
 
 
289 aa  61.2  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  27.81 
 
 
297 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  29.63 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  27.81 
 
 
295 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  27.81 
 
 
297 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
175 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  30.27 
 
 
221 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  26.51 
 
 
295 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  27.81 
 
 
295 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  27.81 
 
 
297 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  26.51 
 
 
297 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  27.41 
 
 
213 aa  60.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  25.34 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  33.01 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>