More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2113 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 180 aa  350  5e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  33.52 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  33.52 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  34.08 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  36.14 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 190 aa  72  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  32.73 
 
 		 166 aa  72  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  35.22 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  30.36 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  37.21 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  34.24 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  33.73 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  27.27 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  34.3 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  32.42 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  35.22 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 222 aa  67  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  33.33 
 
 		 285 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3109  isochorismatase hydrolase  38.32 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456789  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  32.34 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  39.81 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  32.93 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  35.22 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  45.24 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  27.04 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  29.21 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  29.21 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  29.21 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  29.21 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  29.21 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  27.21 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  42.35 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  30.81 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  29.05 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  33.96 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  47.73 
 
 		 210 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  29.05 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  25.75 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  26.47 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  29.05 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  29.05 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  29.05 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  27.71 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  29.05 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  32.74 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  32.74 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01880  nicotinamidase-like amidase  34.32 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  25.53 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  35.05 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  32.74 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  32.74 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  33.63 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  32.74 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3619  isochorismatase  33.16 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  32.74 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  36.46 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  29.45 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  39.76 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  35.29 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  39.18 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  29.12 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  26.83 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  26.83 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3562  isochorismatase hydrolase  38.89 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  32.74 
 
 		 297 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  29.38 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  32.48 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  36.17 
 
 		 232 aa  57.8  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  29.86 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  36.78 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  34.27 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>