More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1386 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 213 aa  444  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  65.15 
 
 		 213 aa  276  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  62.56 
 
 		 213 aa  270  9e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  62.12 
 
 		 201 aa  261  4.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  59.6 
 
 		 217 aa  254  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  60 
 
 		 205 aa  249  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  60.61 
 
 		 204 aa  247  9e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  50.75 
 
 		 214 aa  221  6e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  38.71 
 
 		 209 aa  144  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 212 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0874  isochorismatase hydrolase  34.76 
 
 		 200 aa  121  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5191  isochorismatase hydrolase  35.68 
 
 		 202 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11593  hypothetical protein  36.26 
 
 		 194 aa  112  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.277049  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  33.52 
 
 		 244 aa  98.6  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  29.52 
 
 		 218 aa  98.6  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  31.09 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  33.16 
 
 		 533 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  29.05 
 
 		 377 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  31.8 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  33.88 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  33.33 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 231 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  33.33 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  33.33 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  32.56 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  36.69 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 		 248 aa  89  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  32.79 
 
 		 231 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  29.44 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  31.1 
 
 		 239 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  30.3 
 
 		 192 aa  86.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 		 245 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 		 248 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2596  hypothetical protein  26.77 
 
 		 196 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  31.44 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  31.37 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  29.23 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  29.47 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  32.77 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  31.87 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  34.25 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  31.44 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  31.44 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  27.78 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  27.78 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  27.78 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  27.78 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  32.53 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  27.78 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  27.85 
 
 		 329 aa  78.2  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  32.34 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  31.95 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  28.64 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  28.88 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  31.12 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  29.1 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0690  isochorismatase  32.75 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0385693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  27.89 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 189 aa  74.7  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  28.93 
 
 		 199 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  28.71 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  28.71 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  28.71 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  28.71 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  28.71 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  28.71 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  28.43 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  28.22 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  27.94 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  29.15 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>