More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6845 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 211 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  79.81 
 
 		 218 aa  352  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  53.23 
 
 		 209 aa  231  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  47.87 
 
 		 212 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5191  isochorismatase hydrolase  46.34 
 
 		 202 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  31.09 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 213 aa  95.5  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  28.49 
 
 		 214 aa  92  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  28.93 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1100  isochorismatase hydrolase  27.06 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2078  isochorismatase hydrolase  30.84 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1616  isochorismatase family protein  26.98 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  25.24 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  29.74 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  31.75 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  31.75 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  31.75 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  30.12 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C36  amidase  25.4 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  28.8 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  27.32 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  32.72 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  29.57 
 
 		 377 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  41.46 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  31.12 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  26.36 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  33.93 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  24.22 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  29.06 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  25.11 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  26.8 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  24.22 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2596  hypothetical protein  26.87 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  33.93 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  24.22 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  24.22 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  33.93 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  24.22 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  33.04 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  33.04 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  33.04 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  39.02 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  40.24 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  38.98 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  23.77 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  27.6 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  25.54 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  25.27 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  40.24 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  33.93 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  32.37 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  23.77 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  29.45 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  31.89 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  32.53 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  29.1 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  28.92 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  31.06 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  28.22 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  32.26 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  27.05 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  26.6 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  32.14 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7071  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00539023  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  32.46 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  28.83 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  28.83 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  28.83 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  41.76 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  26.98 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  28.83 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  30.92 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>