More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2596 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2596  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  407  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  37.95 
 
 		 377 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1030  isochorismatase hydrolase  35.68 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  29.23 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 217 aa  98.2  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  29.08 
 
 		 204 aa  95.1  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  28.35 
 
 		 214 aa  94.7  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  29.08 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0874  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  26.77 
 
 		 213 aa  84.7  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  26.9 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  30.05 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  27.78 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  26.9 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  31 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  28.71 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  27.45 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  31.43 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  26.87 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  28.25 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  27.66 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  26.98 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  31.28 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  26.24 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5191  isochorismatase hydrolase  25.12 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  30.37 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  31.11 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11593  hypothetical protein  26.56 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.277049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  31.11 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  30.37 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  30.37 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  30.37 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  27.81 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  27.12 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  26.55 
 
 		 234 aa  62  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  27.16 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  27.81 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  28.32 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  25.64 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  26.29 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  29.63 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  28.15 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  25.81 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  26.53 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  25.27 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  27.12 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  28.29 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  27.87 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  25.65 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  25.99 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  28.4 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  28.4 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  27.4 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  27.59 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  28.4 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  26.53 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  26.55 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  29.48 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  29.48 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  25.26 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  25.13 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  30.81 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  25.76 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  26.73 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  29.48 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  29.48 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  23.78 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  29.48 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  29.48 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  29.48 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  25.26 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  29.45 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  25.24 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  25.77 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  25.13 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  23.24 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  28.57 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>