More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0874 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0874  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11593  hypothetical protein  46.03 
 
 		 194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.277049  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  34.5 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  33 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  34.76 
 
 		 213 aa  121  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  27.69 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  28.57 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2596  hypothetical protein  28.12 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  25.4 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  23.74 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  29.21 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  29.21 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  29.21 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  29.21 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  29.21 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  29.21 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  29.21 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1030  isochorismatase hydrolase  21.39 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  28.23 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  28.08 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5191  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  37.93 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  27.98 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  26.47 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  39.53 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  36.67 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  25.75 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  26.46 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  26.6 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  22.81 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  36.47 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  36.67 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  30.68 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  30.68 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  29.55 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  27.08 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  26.11 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  26.63 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  35.56 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  35.63 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  38.98 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  23.63 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  35.63 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  35.63 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  35.63 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1247  isochorismatase hydrolase  38.98 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127255  normal  0.527652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  35.63 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  22.71 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  26 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  46 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  24.12 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  27.13 
 
 		 316 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 		 240 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  27 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  25.13 
 
 		 228 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  35.8 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  25.67 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  23.98 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  23.26 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  25.13 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  22.89 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  24.26 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7071  isochorismatase hydrolase  27.98 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00539023  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  24.86 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  27.01 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  31.4 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1294  isochorismatase hydrolase  27.52 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  24.26 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  24.26 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  24.26 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  25.93 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  24.26 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  24.26 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  24.26 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  25.44 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  28.42 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  25.41 
 
 		 264 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>