More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5384 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 199 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  54.84 
 
 		 194 aa  192  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  51.89 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  45.08 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7071  isochorismatase hydrolase  45.79 
 
 		 212 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00539023  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  36.65 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  38.41 
 
 		 197 aa  94.7  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  32.46 
 
 		 190 aa  88.6  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  31.94 
 
 		 190 aa  87.8  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  31.94 
 
 		 190 aa  87.8  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  34.22 
 
 		 533 aa  87.8  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  31.94 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  31.94 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  31.94 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  31.94 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  31.94 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 213 aa  85.5  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  32.47 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  41.96 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  32.39 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0201  isochorismatase hydrolase  33.68 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  35.38 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  28.23 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  32.28 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  29.01 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  29.01 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  31.54 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  28.88 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  29.26 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  31.08 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1294  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  35.5 
 
 		 377 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2184  isochorismatase hydrolase  33.89 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0559827  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  39.2 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  30.93 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  28.65 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  30.93 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  30.92 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3865  isochorismatase hydrolase  27.55 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.282134 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3979  isochorismatase hydrolase  27.55 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1017  isochorismatase hydrolase  33.94 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6682  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  31.02 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  27.67 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 		 215 aa  67.8  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  27.27 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  31.85 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  27.84 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3668  isochorismatase hydrolase  28.22 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.856402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  32.64 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  32.6 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  27.94 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  30.73 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  30.61 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  31.12 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5005  putative isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4198  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0364  putative isochorismate hydrolase  29.94 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  31.25 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  26.11 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 		 247 aa  64.7  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  32.22 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>