More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7071 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7071  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
212 aa  426  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00539023  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  57.59 
 
 
200 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  57.84 
 
 
210 aa  201  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  48.98 
 
 
194 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  45.79 
 
 
199 aa  148  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  42.63 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  39.27 
 
 
190 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  39.27 
 
 
190 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  39.27 
 
 
190 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  39.27 
 
 
190 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  39.27 
 
 
190 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  39.27 
 
 
190 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  39.27 
 
 
190 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  30.77 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  31.41 
 
 
197 aa  89  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1294  isochorismatase hydrolase  32.85 
 
 
190 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  33.16 
 
 
533 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  31.34 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  34.32 
 
 
209 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0201  isochorismatase hydrolase  36.08 
 
 
198 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  37.32 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  30.21 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1030  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  28.7 
 
 
233 aa  79  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2011  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.177964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  30.28 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  32.51 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  32.81 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2184  isochorismatase hydrolase  37.02 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0559827  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  39.1 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  32.67 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  31.47 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  27.8 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  31.8 
 
 
223 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  28.41 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  32.38 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  32.86 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  32.86 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  27.56 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  34.13 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  31.5 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  28.57 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  29.29 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  31.53 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  31.18 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  25.63 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  35.34 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  35.48 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  28.51 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  30.57 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  26.97 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2596  hypothetical protein  28.18 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  36.88 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  36.88 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  35.93 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  36.88 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  35.93 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  34.88 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  34.29 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  29.83 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  34.29 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  31.18 
 
 
377 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  34.29 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  34.29 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  34.29 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  28.5 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  26.26 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  28 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  26.82 
 
 
234 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  29.88 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  29.88 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  29.88 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  29.88 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  28.19 
 
 
233 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 
224 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  29.88 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  35.93 
 
 
182 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  29.88 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>