More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0201 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0201  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 198 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  35.18 
 
 		 189 aa  99.4  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  33.33 
 
 		 195 aa  94.4  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  33.68 
 
 		 197 aa  85.1  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  25.37 
 
 		 230 aa  85.1  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  37.41 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  36.16 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  32.9 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  29.76 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  31.52 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  35.25 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  26.19 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  26.83 
 
 		 239 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 239 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  34 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7071  isochorismatase hydrolase  36.08 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00539023  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  31.87 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  29.15 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1017  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  33.56 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  25.12 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  29.33 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  26.82 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  26.82 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  30.57 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  28.5 
 
 		 533 aa  71.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  31.91 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  31.91 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  31.91 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  31.91 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  31.91 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  31.91 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  31.91 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  24.64 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  25.12 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  31.68 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  24.64 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  30.83 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5128  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1030  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 226 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  26.63 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  30.35 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  31.09 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  32.02 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  24.6 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  25.43 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  36.96 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  25.56 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  33.79 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1294  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  28.06 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  28.06 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  26.87 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  26.63 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  27.62 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  28.19 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  25.41 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  26.52 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  29.26 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  28.27 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  31.95 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  32.35 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  27.88 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  27.4 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  27.88 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  27.88 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  27.59 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  28.43 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  35.94 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  27.88 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  27.88 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>