More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5128 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5128  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 220 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1017  isochorismatase hydrolase  40.28 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 191 aa  89.7  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  27.07 
 
 		 184 aa  88.2  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  24.87 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  29.69 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  33.17 
 
 		 533 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  30.7 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  30.53 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  30.1 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  30.77 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  30.43 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  31.15 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  31.15 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  30.77 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  30.77 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  29.56 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  30.77 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  29.56 
 
 		 228 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  30.64 
 
 		 203 aa  72  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  30.32 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  28.57 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  29.84 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  31.61 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  29.86 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  33.88 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  30.5 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  28.26 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  30.04 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  29.51 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  35.09 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  29.57 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  29.51 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  25.12 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  27.49 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  31.73 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  30.12 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  33.62 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  30.26 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  32.4 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  27.53 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  26.55 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  31.73 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  27.39 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  29.05 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  39.08 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  32.94 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  28.18 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  37.37 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  35.23 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  25.85 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  32.09 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  29.93 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  28.71 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  24.88 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  28.07 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0201  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  27.89 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  26.55 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  27.6 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  37.96 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  28.92 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  28.31 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>