More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3317 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  51.55 
 
 		 195 aa  198  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 190 aa  199  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  51.09 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  49.71 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  47.37 
 
 		 188 aa  154  6e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  45.03 
 
 		 191 aa  149  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  39.34 
 
 		 235 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  29.47 
 
 		 230 aa  96.3  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 		 222 aa  94.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2022  isochorismatase hydrolase  36.42 
 
 		 221 aa  91.7  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85317  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 240 aa  87.8  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  28.57 
 
 		 389 aa  87.8  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 		 234 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  31.4 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  29.69 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  29.32 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  30.21 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  31.91 
 
 		 233 aa  81.3  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 		 234 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  30.05 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  30.16 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  31.09 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  29.23 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  28.25 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  29.65 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  33.87 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  33.99 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  30.81 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  31.74 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  29.11 
 
 		 231 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  30.97 
 
 		 182 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  29.11 
 
 		 231 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  31.55 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  28.1 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 248 aa  71.6  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  28.77 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  29.11 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  29.11 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  32.53 
 
 		 237 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  29.11 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  29.11 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  29.47 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  27.1 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  32.46 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  28.64 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  30.17 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  36.3 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  30.73 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  25.95 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  35.56 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  30.32 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  32.14 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  30.29 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  26.63 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  26.8 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  31.45 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  29.85 
 
 		 247 aa  68.2  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  29.41 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>