More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2981 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  100 
 
 		 227 aa  463  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  90.57 
 
 		 212 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  35.59 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  32.53 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  32.38 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  32.38 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  31.9 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  31.9 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  31.9 
 
 		 230 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  31.9 
 
 		 230 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  31.9 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  34.74 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  30.38 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  35.51 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  30.36 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  31.12 
 
 		 193 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  32.86 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  35.51 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  29.08 
 
 		 192 aa  99.8  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  35.87 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  30.08 
 
 		 246 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  34.76 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 		 232 aa  96.7  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  32.07 
 
 		 192 aa  96.3  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  35.48 
 
 		 227 aa  94.7  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  35.32 
 
 		 247 aa  94.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  30.13 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 252 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 201 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  36.02 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  33.03 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 		 201 aa  93.2  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 		 187 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 199 aa  93.2  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 190 aa  92.8  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  25.7 
 
 		 207 aa  92.4  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  34.74 
 
 		 231 aa  92  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 201 aa  91.7  9e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  28.91 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  30.23 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  31.48 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  34.25 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 190 aa  90.5  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  31.55 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  33.14 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 189 aa  89.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  37.58 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  35.83 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  35.83 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 226 aa  89  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  32.37 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  33.69 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  33.92 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  33.69 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  33.87 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  31.8 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  31.89 
 
 		 239 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  30.5 
 
 		 233 aa  85.5  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  32.07 
 
 		 218 aa  85.5  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  34.46 
 
 		 227 aa  85.1  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  28.98 
 
 		 213 aa  85.5  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  33.13 
 
 		 213 aa  85.1  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  28.76 
 
 		 236 aa  85.1  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  33.13 
 
 		 196 aa  85.1  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 218 aa  84.7  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  29.29 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  31.09 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  32.48 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  32.32 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  33.71 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  28.37 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  34.86 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  31.76 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  30.46 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  33.03 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  30.85 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  31.08 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  31.08 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  31.08 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  30.85 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  29.22 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  26.11 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>