More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2641 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 195 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  64.55 
 
 		 190 aa  266  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  51.55 
 
 		 193 aa  198  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  50.27 
 
 		 189 aa  188  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  52.51 
 
 		 204 aa  185  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  46.2 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  45.81 
 
 		 191 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  44.56 
 
 		 215 aa  160  8.000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  37.84 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2022  isochorismatase hydrolase  34.9 
 
 		 221 aa  95.9  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85317  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  29.89 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  31.77 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  28.57 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  29.06 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  31.74 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  35.25 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  32.68 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  27.67 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  30.27 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  30.21 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  28.66 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  32.92 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  24.5 
 
 		 313 aa  72  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  29.84 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  29.23 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  29.88 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  31.64 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  29.24 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  30.43 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  29.69 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  30.99 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  27.74 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  32.75 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  32.1 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  32.1 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  30.34 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  32.1 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  31.13 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  29.79 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  30.36 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  24.87 
 
 		 316 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 230 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  25.77 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  29.84 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  28.18 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  27.96 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  27.49 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  25.15 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  27.49 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  28.11 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  27.49 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  27.49 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  26.6 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  27.13 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  26.67 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  26.67 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  26.23 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  33.59 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  32.28 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  28.49 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>