More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0235 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 316 aa  647    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  68.28 
 
 		 313 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  65.36 
 
 		 316 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  44.13 
 
 		 187 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  42.2 
 
 		 210 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  37.99 
 
 		 181 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  38.55 
 
 		 181 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  39.11 
 
 		 181 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  37.99 
 
 		 181 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  41.98 
 
 		 199 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  38.76 
 
 		 182 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  37.16 
 
 		 187 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  37.16 
 
 		 187 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  37.16 
 
 		 187 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  36.61 
 
 		 187 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  36.61 
 
 		 187 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  39.56 
 
 		 184 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  36.87 
 
 		 187 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  36.87 
 
 		 187 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  37.99 
 
 		 181 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  41.67 
 
 		 185 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  38.86 
 
 		 193 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 181 aa  126  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  42.22 
 
 		 182 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  36.16 
 
 		 193 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  40.78 
 
 		 186 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 		 184 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  35.8 
 
 		 182 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 		 181 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  35.75 
 
 		 180 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 185 aa  116  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1247  isochorismatase hydrolase  40.44 
 
 		 190 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127255  normal  0.527652 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 182 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  39.13 
 
 		 182 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 		 190 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 		 182 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  39.13 
 
 		 182 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0449  hypothetical protein  43.33 
 
 		 121 aa  102  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  38.57 
 
 		 172 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 		 199 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  34.42 
 
 		 207 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 223 aa  95.1  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  30.17 
 
 		 182 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  37.33 
 
 		 199 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  37.33 
 
 		 199 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  37.33 
 
 		 199 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  34.41 
 
 		 190 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 191 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 		 342 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3976  isochorismatase hydrolase  36.3 
 
 		 178 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  35.62 
 
 		 177 aa  89  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 		 198 aa  87.8  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  32.91 
 
 		 174 aa  87  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  37.76 
 
 		 199 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05268  hypothetical protein  39.17 
 
 		 123 aa  86.7  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  37.68 
 
 		 199 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 		 199 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  30.73 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  32.69 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  30.94 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  30.94 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  30.94 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  36.96 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  40.69 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 186 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 203 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  33.8 
 
 		 201 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  36.43 
 
 		 212 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  34.23 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  33.13 
 
 		 203 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  32.48 
 
 		 200 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  31.9 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  29.21 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  29.78 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0975  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.8451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  32.53 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  32.37 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  32.37 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  29.75 
 
 		 176 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  33.1 
 
 		 201 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  38.26 
 
 		 199 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  25.7 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 196 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  28.92 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  31.65 
 
 		 176 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  29.67 
 
 		 184 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  28.42 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  30.54 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  35.39 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  30.54 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  36.42 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  29.9 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2042  isochorismatase hydrolase  32.89 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40855  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  30.56 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  29.94 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  35.21 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  32.86 
 
 		 218 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>