More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3931 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
224 aa  454  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  91.32 
 
 
231 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  77.72 
 
 
216 aa  324  8.000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  72.82 
 
 
215 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  72.82 
 
 
215 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  72.82 
 
 
215 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  75.9 
 
 
211 aa  304  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  73.66 
 
 
208 aa  302  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  73.47 
 
 
223 aa  295  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  66.67 
 
 
213 aa  278  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  43.94 
 
 
210 aa  165  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  43.59 
 
 
227 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  44.78 
 
 
213 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  44.78 
 
 
213 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  44.78 
 
 
213 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  43.09 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  43.3 
 
 
216 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  46.96 
 
 
211 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  43.07 
 
 
213 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  41.08 
 
 
213 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  39.3 
 
 
209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  38.97 
 
 
208 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  39.7 
 
 
207 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  42.39 
 
 
215 aa  128  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  40.22 
 
 
209 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  46.37 
 
 
198 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  39.45 
 
 
227 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  33.85 
 
 
218 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  40.54 
 
 
242 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
210 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 
236 aa  98.6  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  32.91 
 
 
219 aa  93.2  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  30.84 
 
 
247 aa  92.8  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 
223 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 
221 aa  89  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 
212 aa  88.2  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  34.68 
 
 
195 aa  87.4  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  36.13 
 
 
252 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 
191 aa  84  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  37.22 
 
 
204 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 
187 aa  79  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  29.47 
 
 
223 aa  77  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  37.97 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  32.51 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  37.97 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  36.11 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  37.43 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  37.41 
 
 
200 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  33.88 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  28.41 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  35.19 
 
 
199 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 
187 aa  71.2  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2915  isochorismatase hydrolase  29.69 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  27.98 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  27.84 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  33.92 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  31.19 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  30.22 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  28.65 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  32.75 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  34.9 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  30.34 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  32.31 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  39.13 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  31.15 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  29.53 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 
190 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  28.41 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  30.77 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  35.15 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0688  isochorismatase hydrolase  29.1 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  26.97 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  31.07 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  31.52 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  27.94 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  27.45 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  31.09 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  27.96 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>