More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1098 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
221 aa  455  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  34.22 
 
 
227 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  35.17 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  36.73 
 
 
252 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  34.63 
 
 
210 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  35.64 
 
 
227 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  36.27 
 
 
214 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  34.39 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 
218 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  33.66 
 
 
213 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  37.31 
 
 
207 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  33.67 
 
 
213 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  33.67 
 
 
213 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  33.67 
 
 
213 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  38.79 
 
 
211 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
209 aa  99.4  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  32.85 
 
 
209 aa  98.6  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  33.65 
 
 
216 aa  96.7  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  31.79 
 
 
211 aa  95.1  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  35.95 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  36.67 
 
 
208 aa  92  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  47.31 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 
224 aa  89  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  34.16 
 
 
215 aa  88.6  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  42.31 
 
 
213 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  30.5 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  29.91 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  29.91 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  29.91 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  40.4 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 
213 aa  82  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  31.19 
 
 
223 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  48.94 
 
 
198 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  42.71 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  29.81 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  30.58 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  24.75 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  43.14 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  43.14 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  33.06 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  42.16 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 
215 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  27.46 
 
 
190 aa  59.3  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 
195 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  31.91 
 
 
359 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  29.25 
 
 
185 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  27.89 
 
 
289 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  26.46 
 
 
195 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  28.11 
 
 
182 aa  55.8  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  35.56 
 
 
247 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  35.78 
 
 
199 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  33.62 
 
 
186 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  34.52 
 
 
240 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.044592 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  25.34 
 
 
185 aa  55.5  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_8142  predicted protein  37.65 
 
 
96 aa  55.5  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  35.04 
 
 
214 aa  55.5  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  33.64 
 
 
198 aa  55.1  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  26.88 
 
 
187 aa  55.1  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 
188 aa  55.1  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  29.79 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  25.87 
 
 
189 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  31 
 
 
190 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  37.11 
 
 
198 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  23.5 
 
 
186 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  26.17 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  28.39 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  23.5 
 
 
186 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  28.99 
 
 
270 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  29.66 
 
 
359 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  34.44 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  32.74 
 
 
185 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6682  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  31.58 
 
 
184 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  32.46 
 
 
184 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  36.27 
 
 
199 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  31.21 
 
 
176 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  25.14 
 
 
193 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  25.14 
 
 
193 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 
234 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  31.21 
 
 
176 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  25.14 
 
 
193 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  31.21 
 
 
176 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  36.27 
 
 
199 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
235 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  36.27 
 
 
199 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  27.74 
 
 
231 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  27.74 
 
 
231 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 
226 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 
316 aa  52  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 
200 aa  52  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 
226 aa  52  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
230 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
230 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  31.51 
 
 
187 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  29.37 
 
 
222 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>