More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2765 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
230 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
230 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  82.17 
 
 
230 aa  387  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  74.34 
 
 
240 aa  345  4e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  72.2 
 
 
236 aa  332  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  68.08 
 
 
228 aa  297  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  68.78 
 
 
240 aa  293  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  71.03 
 
 
226 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  66.05 
 
 
223 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  70.56 
 
 
226 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  70.56 
 
 
226 aa  280  9e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  66.97 
 
 
233 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  60.55 
 
 
231 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  62.38 
 
 
231 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  60.95 
 
 
223 aa  266  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  59.56 
 
 
236 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  61.47 
 
 
223 aa  263  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  59.45 
 
 
232 aa  252  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  61.43 
 
 
222 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  61.43 
 
 
222 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  61.43 
 
 
222 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  58.06 
 
 
225 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  62.79 
 
 
229 aa  250  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  59.42 
 
 
222 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  59.9 
 
 
222 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  56.62 
 
 
225 aa  244  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  58.45 
 
 
227 aa  241  9e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  53.74 
 
 
232 aa  222  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  56.93 
 
 
247 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  51.95 
 
 
228 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  51.29 
 
 
228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  51.3 
 
 
233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  52.44 
 
 
234 aa  210  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  52.25 
 
 
241 aa  209  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  53.66 
 
 
227 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  50.22 
 
 
227 aa  209  4e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  51.79 
 
 
231 aa  208  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  48.68 
 
 
230 aa  207  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  49.32 
 
 
233 aa  207  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  50.45 
 
 
239 aa  205  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  50.45 
 
 
239 aa  205  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  47.81 
 
 
230 aa  203  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  49.11 
 
 
234 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  50 
 
 
239 aa  201  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  46.34 
 
 
230 aa  196  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  47.77 
 
 
234 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  46.82 
 
 
389 aa  191  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  41.44 
 
 
281 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  41.85 
 
 
240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  44.02 
 
 
231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  36.99 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  33.78 
 
 
266 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  32.41 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  33.48 
 
 
231 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  32.27 
 
 
233 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  34.21 
 
 
274 aa  111  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  33.04 
 
 
230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  33.04 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  33.04 
 
 
230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  33.04 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  33.04 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 
231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  32.6 
 
 
231 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  29.95 
 
 
241 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  34.51 
 
 
248 aa  101  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  32.27 
 
 
245 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  30.56 
 
 
244 aa  99.4  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  34.68 
 
 
258 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  31.96 
 
 
246 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  34.51 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  32.29 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 
226 aa  92.8  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
201 aa  92  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 
201 aa  91.7  9e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 
201 aa  91.3  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  32.21 
 
 
329 aa  89.4  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  30.53 
 
 
224 aa  89  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 
196 aa  89  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  32.91 
 
 
224 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.44 
 
 
214 aa  88.6  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  31.6 
 
 
212 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
221 aa  88.6  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 
217 aa  88.2  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  31.34 
 
 
256 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  32.08 
 
 
227 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 
201 aa  86.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  32.92 
 
 
201 aa  85.5  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  29.11 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 
192 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 
193 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  27.68 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  31.49 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  29.03 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  27.68 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 
192 aa  82  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>