More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6453 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
234 aa  484  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  95.3 
 
 
234 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  87.12 
 
 
233 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  77.38 
 
 
227 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  75.66 
 
 
230 aa  360  8e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  76 
 
 
230 aa  360  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  73.68 
 
 
231 aa  360  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  73.21 
 
 
239 aa  358  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  76.34 
 
 
234 aa  358  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  71.74 
 
 
239 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  76.02 
 
 
228 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  71 
 
 
239 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  75.11 
 
 
228 aa  351  7e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  72.97 
 
 
230 aa  345  5e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  69.64 
 
 
232 aa  337  7e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  72.32 
 
 
233 aa  336  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  69.37 
 
 
227 aa  328  5.0000000000000004e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  69.23 
 
 
241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  67.74 
 
 
247 aa  311  5.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  51.12 
 
 
389 aa  245  4.9999999999999997e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  48.85 
 
 
231 aa  222  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  52.25 
 
 
226 aa  221  8e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  49.1 
 
 
240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  51.8 
 
 
226 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  50.9 
 
 
226 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  52.45 
 
 
228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  50.45 
 
 
236 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  48.6 
 
 
227 aa  207  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  50.92 
 
 
223 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  50.22 
 
 
240 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.044592 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  51.58 
 
 
222 aa  205  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  51.58 
 
 
222 aa  205  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  51.58 
 
 
222 aa  205  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  48.42 
 
 
240 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  50.43 
 
 
233 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  47.96 
 
 
223 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  46.61 
 
 
222 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  46.61 
 
 
222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  45.05 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  44.93 
 
 
231 aa  195  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  48.36 
 
 
225 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  47.44 
 
 
223 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  46.93 
 
 
230 aa  191  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  44.49 
 
 
231 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  49.11 
 
 
230 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  49.11 
 
 
230 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  45.54 
 
 
225 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  43.24 
 
 
236 aa  177  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  47.2 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  36.5 
 
 
281 aa  162  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  34.7 
 
 
266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  33.82 
 
 
274 aa  111  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 
248 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  32.42 
 
 
241 aa  99.4  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  30.51 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  28.97 
 
 
244 aa  95.1  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  29.6 
 
 
231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  29.15 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  29.15 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  29.15 
 
 
231 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  29.15 
 
 
231 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  29.15 
 
 
231 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 
233 aa  92.4  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  28.95 
 
 
231 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  28.51 
 
 
231 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 
248 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 
224 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  30.66 
 
 
214 aa  90.1  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  30.04 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  33.69 
 
 
227 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 
252 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 
201 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 
221 aa  85.5  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
217 aa  85.9  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 
247 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  28.92 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  29.79 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  29.1 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  29.54 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  31.79 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  31.02 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  31.02 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  31.02 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  31.02 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  31.02 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  31.02 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  31.02 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  32.16 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  31.02 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  29.56 
 
 
217 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 
226 aa  79  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  29.53 
 
 
213 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>