More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3089 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  100 
 
 
227 aa  460  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  92.89 
 
 
214 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  76.47 
 
 
210 aa  321  7e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  57 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  56.6 
 
 
211 aa  222  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  54.03 
 
 
213 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  54.03 
 
 
213 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  53.99 
 
 
213 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  53.52 
 
 
213 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  48.31 
 
 
218 aa  210  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  53.61 
 
 
209 aa  202  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  49.51 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  50.96 
 
 
215 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  52.76 
 
 
207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  43.78 
 
 
216 aa  168  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  51.49 
 
 
242 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  49.2 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  40.85 
 
 
247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  43.56 
 
 
208 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  43.94 
 
 
213 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  46.28 
 
 
211 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  41.35 
 
 
208 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  42.21 
 
 
215 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  42.21 
 
 
215 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  42.21 
 
 
215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  43.59 
 
 
231 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  43.59 
 
 
224 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  43.16 
 
 
223 aa  151  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  39.35 
 
 
236 aa  151  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  48.68 
 
 
198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  40.85 
 
 
210 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  36.49 
 
 
219 aa  134  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  35.94 
 
 
227 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  40.58 
 
 
251 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  39.13 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  35.64 
 
 
221 aa  113  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  27.43 
 
 
213 aa  89.4  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 
187 aa  86.7  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  34.46 
 
 
227 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  36 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  33.88 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  31.35 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  31.08 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  24.14 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  27.33 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  28.64 
 
 
244 aa  72  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  25.7 
 
 
193 aa  72  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  28.92 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  27.05 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6174  isochorismatase hydrolase  33.56 
 
 
196 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.122012 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  30.48 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  25.95 
 
 
186 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  25.95 
 
 
186 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  29.84 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  30.48 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2624  isochorismatase hydrolase  33.97 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.722886  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  30.48 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 
231 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  30.48 
 
 
231 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  30.48 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  35.19 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  31.47 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  28.9 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  28.99 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  33.11 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.820644 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  26.54 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  29.87 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 
289 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  30 
 
 
231 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  25.71 
 
 
233 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  26.86 
 
 
213 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
226 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  32.58 
 
 
186 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  36.3 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  25.62 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 
189 aa  63.2  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  27.49 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 
196 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  26.2 
 
 
189 aa  62.4  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  26.84 
 
 
247 aa  62  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  30.18 
 
 
195 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  28.71 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 
202 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  27.72 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>