More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2747 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  100 
 
 		 216 aa  431  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 218 aa  209  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  51.67 
 
 		 210 aa  204  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  45.37 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  49.51 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  49.5 
 
 		 214 aa  194  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  49.2 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  48.42 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  43.75 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  43.75 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  43.75 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  45.1 
 
 		 213 aa  174  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  44.02 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  43.54 
 
 		 211 aa  171  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  51.35 
 
 		 198 aa  157  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  45.23 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  44.28 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  41.46 
 
 		 242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  43.3 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  38.42 
 
 		 213 aa  145  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  39.8 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  39.3 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  39.3 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  43.09 
 
 		 211 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  40.5 
 
 		 231 aa  141  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  41.67 
 
 		 223 aa  141  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  41.75 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  39.32 
 
 		 216 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 227 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  36.55 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  34.72 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  37.19 
 
 		 210 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  35.48 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  37.9 
 
 		 251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  33.65 
 
 		 221 aa  96.7  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  33.63 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  28.32 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2624  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.722886  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  30.77 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  32.99 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 215 aa  72  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  34.56 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  27.96 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  27.89 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  29.47 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  31.09 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  28.36 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  27.18 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  27.66 
 
 		 230 aa  62  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  28.98 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  34.62 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  34.62 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  34.62 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  25.53 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  29.41 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  35.37 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  30.65 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  26.32 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6174  isochorismatase hydrolase  49.18 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  26.9 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  30.12 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  26.49 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  26.49 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  26.49 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  24.02 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  28.88 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  28.31 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  26.49 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  29.69 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  26.49 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>